Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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