Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ttc39dQ0VF76 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ttc39dQ0VF76 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms