Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pkp1P97350 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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