Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms