Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd8P23463 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms