Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
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