Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sp100O35892 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sp100O35892 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sp100O35892 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sp100O35892 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Sp100O35892 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sp100O35892 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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