Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc180J3QNE4 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccdc180J3QNE4 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccdc180J3QNE4 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccdc180J3QNE4 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccdc180J3QNE4 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccdc180J3QNE4 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccdc180J3QNE4 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccdc180J3QNE4 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccdc180J3QNE4 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ccdc180J3QNE4 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccdc180J3QNE4 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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