Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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