Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Speer3W4VSP1 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Speer3W4VSP1 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Speer3W4VSP1 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Speer3W4VSP1 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Speer3W4VSP1 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Speer3W4VSP1 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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