Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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