Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gtf3c6Q9D8P7 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gtf3c6Q9D8P7 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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