Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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