Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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