Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NischQ80TM9 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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