Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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