Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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