Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms