Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gjb1P28230 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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