Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Spta1P08032 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Spta1P08032 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spta1P08032 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms