Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms