Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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H2-Q1O19441 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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H2-Q1O19441 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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H2-Q1O19441 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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H2-Q1O19441 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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H2-Q1O19441 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
H2-Q1O19441 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.4 ms