Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Gm8356J3QPD3 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms