Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprsB0V2N1 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprsB0V2N1 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms