Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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