Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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