Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Speer3W4VSP1 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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