Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Col5a3Q9JLI2 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Col5a3Q9JLI2 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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