Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Usp29Q9ES63 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms