Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Capns2Q9D7J7 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms