Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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