Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rprd1bQ9CSU0 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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