Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Top1mtQ8R4U6 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Top1mtQ8R4U6 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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