Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg9aQ68FE2 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg9aQ68FE2 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms