Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms