Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Klhdc9Q3USL1 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms