Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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