Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Cpne9Q1RLL3 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms