Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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