Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms