Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms