Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprmP28828 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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