Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
P10404 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
P10404 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
P10404 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms