Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Opn1mwO35599 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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