Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PtprbB2RU80 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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PtprbB2RU80 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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PtprbB2RU80 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PtprbB2RU80 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PtprbB2RU80 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PtprbB2RU80 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
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PtprbB2RU80 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
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PtprbB2RU80 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprbB2RU80 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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