Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Grik3B1AS29 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms