Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CtcflA2APF3 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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