Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc47Q9D024 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms