Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Ccdc71Q8VEG0 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Ccdc71Q8VEG0 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc71Q8VEG0 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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