Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prpf39Q8K2Z2 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Prpf39Q8K2Z2 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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